若合伙人为自然人，则无需按照工资薪金所得缴纳个人所得税。他们只需根据个体工商户的生产经营所得进行按月或按季预缴，并在年终进行汇算清缴。
对于实行核定征收的个人独资、合伙企业，投资者需在每季度结束后15日内及年度结束后30日内，向主管税务机关提交《核定征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度（季度）申报表》，并缴纳相应的个人所得税。
而对于实行查帐征收的投资者，其个人所得税应按年计算，分季预缴。投资者应在每季度结束后15日内预缴，并向主管税务机关提交《查帐征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度（季度）申报表》。年度结束后的3个月内，投资者应进行汇算清缴，多退少补，并同时向主管税务机关提交《查帐征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度(季度)申报表》，附上年度会计决算报表和预缴个人所得税纳税凭证。