在纳税年度内进行多项研发活动的企业，应按照不同研发项目分别归集可加计扣除的研发费用。这有助于确保费用的准确性和合理性，并避免混淆不同研发项目的开支。
此外，企业应对研发费用和生产经营费用进行分别核算。通过准确、合理地归集各项费用支出，企业能够更好地掌握和管理自身的财务状况。然而，对于划分不清的费用，企业不得实行加计扣除政策。
综上所述，企业在处理研发支出时，应遵循**财务会计制度的要求，并按照研发项目设置辅助账来准确归集核算可加计扣除的研发费用。同时，企业还应将研发费用与生产经营费用进行分别核算，以确保费用的准确和合理归集。对于划分不清的费用，企业应遵守规定，不得实行加计扣除政策。