首先，经济仲裁适用于平等民事主体之间的经济纠纷关系，处理的是经济合同纠纷和财产权益纠纷；而劳动仲裁则适用于个人与单位之间劳动关系，处理的是个人与用人单位之间在工资、劳保、辞职辞退、劳动补偿以及工伤等方面产生的劳动争议。
其次，经济仲裁机构是依照《仲裁法》的规定由地市人民政府组建的专门处理经济纠纷的独立部门，劳动仲裁机构则是依据劳动法律、法规规定在劳动部门设立的处理劳动争议的组织。
此外，经济仲裁必须当事人双方在合同中订有明确具体的仲裁条款或者事后已达成仲裁协议才能申请立案。而劳动仲裁是法律规定解决劳动争议的必经程序，只要个人与用人单位签有劳动合同或者形成事实上劳动关系，发生劳动争议后就可以申请立案。
在适用法律方面，经济仲裁适用的是民商事法律、法规以及**惯例和商业规则。而劳动仲裁处理的是劳动争议适用的是《劳动法》及其相关法律法规。
**，在仲裁效力方面，经济仲裁属于一裁终局，裁决一经做出即具有法律效力，除非法定原因，当事人不能再提**讼。而劳动仲裁是处理劳动争议的前置程序，当事人不服劳动仲裁，多数情况下可以再提**讼。