在处理账务时，需要将过路费的电子发票记录在账簿中。具体的账务处理方式如下：
首先，借方科目选择“管理费用”等相关科目。这一科目用于记录单位发生的各种管理费用，包括过路费等。
然后，贷方科目选择“银行存款”等相关科目。这一科目用于记录单位的银行存款变动情况，包括支付过路费后的余额变化。
通过以上账务处理，可以确保单位车辆发生过路费支出的记录准确无误。同时，电子发票的使用也提高了财务管理的效率和便利性。
需要注意的是，单位在处理账务时应严格按照会计准则和相关法规进行操作，确保账务处理的准确性和合规性。此外，单位还应建立健全的内部控制制度，加强对账务处理过程的监督和管理，以防止潜在的财务风险和错误。
总之，单位车辆发生过路费支出时，可以通过要求高速公路公司开具电子发票，并按照相应的账务处理方式进行入账核算。这样可以确保财务记录的准确性和合规性，提高财务管理的效率和便利性。