首先，从应税性质来看，增值税一般采用核定征收的方式。这种模式下，税务机关会根据企业登记的资料进行税收计算，无需企业提供相关证据。而消费税、营改增税收、企业所得税等，则通常采用查账征收，这要求企业必须对税收进行报告，并提供相应的资料和凭证。
其次，从税务管理程序来看，如果个体工商户具有持续缴纳税收的条件，且税收程序可控，那么一般采用核定征收。反之，如果税收程序不可控，或者缴纳税收不稳定，那么就更倾向于使用查账征收。
此外，各种不同形式的小型微利企业，如家庭农场，渔业养殖企业等，也一般采用查账征收。
根据《税收法》规定，企事业单位和个体工商户，必须建立内部税收管理制度，实行财务会计制度和税收备案制度，建立相关的内部控制机制，对税收收入和支出予以合理记录和监督，针对财务数据进行完整的记录，便于进行充分核实，以保证税务程序的准确性、合规性和审计效果。